ยาหยอดตาต้องใช้เฉพาะบุคคลของใครของมัน ห้ามซื้อใช้เอง และควรจะใช้เมื่อแพทย์สั่ง และหยอดตามจำนวนที่แพทย์สั่งเท่านั้น อย่าหยอดต่อเนื่อง เมื่อใช้แล้วหายจากอาการของโรค ต้องทิ้งยาไปเลย และถ้ามีอาการกลับมาอีกก็ต้องไปพบแพทย์ใหม่ ห้ามเก็บยาที่เหลือไว้แล้วนำมาใช้อีกอย่างเด็ดขาด
โดยทั่วไปยาหยอดตา ๑ ขวด เมื่อเปิดขวกออกแล้วให้ใช้ได้ไม่เกิน ๑ เดือน ถ้าสมมุติว่าเราใช้ไป ๒ สัปดาห์แล้วไม่ได้หยอดอีก จึงเก็บเอาไว้ พอครบ ๑ เดือนยาจะเสียใช้ไม่ได้ต้องทิ้งไปเลย
ยาบางชนิดที่ขวดเป็นสีชา นั่นแสดงว่ายาชนิดนั้นถูกแสงมากไม่ได้ ก็ควรจะเก็บไว้ในที่ที่ไม่มีแสงจ้า บางชนิดต้องเก็บไว้ในตู้เย็น เพื่อให้คงสภาพของยา แต่โดยทั่วไปยาหยอดตาสามารถวางไว้ทั่ว ๆไปได้
ก่อนใช้ยาหยอดตาทุกครั้งขอให้ปฏิบัติดังนี้
ดูให้แน่ใจว่ายาที่ใช้เป็นยาหยอดตา เพราะเคยมีคนเอายาหยอดจมูก หยอดหู มาหยอดตา เพราะลักษณะขวดเหมือนกัน จึงต้องแน่ใจว่าเป็นยาหยอดตา เพราะมียาหยอดตาบางตัวสามารถหยอดได้ทั้งตาและหู
ใช้เฉพาะบุคคล ห้ามใช้ปะปนกันอย่างเด็ดขาด เพราะในทางปฏิบัติ เราใช้ยาหยอดตาคล้ายยาสามัญประจำบ้าน คือ หยิบมาใช้เลย โดยไม่ดูว่าเป็นของใครในครอบครัว
ดูวันหมดอายุ ในทุกขวดจะมีวันบอกว่าหมดอายุเมื่อไร แต่ถ้าเป็นยาขวดที่เราเปิดแล้ว ให้ดูวันที่ที่เราใช้ ถ้าเกิน ๑ เดือน ควรจะทิ้ง สมมุติว่าไม่มีวันที่ให้ลองเปิดขวดยาแล้วหยดดูว่ายาขวดนี้ที่เคยใส ถ้ายังใสอยู่ ก็ใช้หยอดได้ แต่ถ้าเดิมยาใส แล้วมีสีขุ่น ควรจะทิ้ง หรือยาเดิมไม่มีสี แต่กลายเป็นสีเหลืองก็ควรทิ้ง
เวลาหยอดตาอย่าให้ปลายจุกหรือนิ้วสัมผัสกับตา หยดลงไปเพียง ๑ หยด แค่ ๑ หยดก็เพียงพอแล้ว ถ้าหยอดมากกว่านั้นยาอาจจะหกหมด เป็นการสูญเสียโดยใช่เหตุ เพราะยาบางอย่างราคาแพง
หลังจากหยอดตา ให้หลับตา ๕-๑๐ วินาที หรือใช้นิ้วชี้กดที่หัวตาไว้สัก ๑๐ วินาที เพื่อที่ยาจะได้เข้าตาเต็มที่ไม่ไหลลงคอ แล้วทำให้รู้สึกขม
หลังใช้ยาแล้วปิดจุกขวดให้เรียบร้อยเหมือนเดิม วางในที่อันควร และไม่ให้เด็กหยิบถึง